Планета Пандора уникальна своей необычной флорой, фауной и природными ресурсами, на которые однажды решили позариться алчные завоеватели с Земли. Отправив сюда армады воинственных кораблей, они попытались колонизировать этот мир, уничтожая местные племена, оказавшие им яростное сопротивление в борьбе за свою свободу. Однако среди военных был один человек, который не захотел пачкать руки в крови мирного народа нави. Джейк Салли, синхронизировал свой разум с аватаром и стал частью свободолюбивого племени, впоследствии возглавив его, поклявшись и дальше оберегать его от любых врагов. Спустя десять лет он продолжает изучать удивительный мир Пандоры, вместе со своей возлюбленной Найтири воспитывая общих детей. Его жизнь была наполнена гармонией и умиротворением до тех пор, пока на планете снова не высадились военные корабли, стремясь довести начатое до конца. Спасая семью от надвигающейся угрозы, Джейк сталкивается с ранее неизвестной расой меткаинов, обитающих в океанских глубинах Пандоры. Грядет новая битва за выживание и в ней эти подводные существа сыграют не последнюю роль.